尹祈9岁时,同师弟杉华随师父游历江湖,在沙漠边,捡到了一个小女娃。当时女娃正发着高烧,三人抱着女娃到附近的城中诊治。因着女娃衣服上绣着一个“凉”字,征得师父同意后,尹祈给女娃起名为,夜初凉。
后来,三人带着夜初凉回到千山。在君兮生活在时夜谷的第二年,千时夜告诉了尹祈三人关于千山的诅咒。尹祈也得知为何之前从未有女子生活在千山。
就这样,尹祈养了夜初凉十几年。在这十几年里,夜初凉对尹祈格外依赖,后来尹祈及冠,千时夜作为二人长辈,为两人订了婚。在成婚之日,一群黑衣人杀进时夜谷,死伤无数,尹祈在夜初凉怀中断了气。
从这之后,夜初凉消沉了将近一年。在这一年里,一直呆在时夜谷属于他们两人的小院中。
自小在江湖组织中长大,夜初凉很是向往江湖上的生活。以前尹祈在时,不舍得让她卷入江湖纷争。尹祈死后,千时夜出关,认命杉华和夜初凉为分别为时夜谷暗阁和隐阁阁主,对外统称暗隐阁主青衫隐。
再后来,夜初凉去到京城杉华的府中,等及笄之后,留下一封信,不告而别,独自一人闯荡江湖。
隐阁擅长打探消息与暗杀,夜初凉离开京城后,利用隐阁的人脉,四处奔走,哪里有纷争哪里便有隐阁君兮。再加上青落斋的势力,君兮在江湖上混的风生水起的。
时间长了,君兮觉得在夜星国有些无聊,便去了隐阁在南疆的分部。
一次,南疆王凤寒去隐阁想要打探消息,正巧遇上了坐镇的君兮,两人发现自己与对方很是相像,通过验证,证实了两人的兄妹关系。
之后,在凤寒的劝说下,君兮回到了夜星国。不久,夜星国皇上单方面撕毁两国的和平条约,向南疆发兵,多年前的一桩阴谋,也开始渐渐浮现。
君兮隐匿在军中,在军中混了个不错的职位,本想着看两国之间有没有再次和谈的机会,却在无意中发现其中一位带兵将领是自己心心念念的人。感觉到自己一直以来都是在被欺骗,君兮气愤的离开军营,再度回到南疆,找到自己的哥哥。
那边杉华在听说了尹祈带兵的事情后,想着君兮之前给他写的信,也离开京城去了南疆。
三人在南疆碰了面。对于尹祈当年的诈死,杉华与君兮都是埋怨的,都有不被信任的感觉。后来,两人知道了尹祈当年的良苦用心,原谅了他。
夜星国当朝皇帝残暴昏庸,在得到了南疆的帮助后,尹祈恢复了自己的身份—夜川宸,当年老王爷的长子,夜川霁的同胞哥哥。
与此同时京城里,老王爷“死而复生”,拆穿了自己的侄子—夜星国当朝皇帝的谎言。皇帝郁结攻心,吐血身亡,太后一党带兵想要灭口,被及时赶回来的夜川宸拦下。
在其他的将领和一众官员的推举下,夜川宸即位当了皇帝。
夜川宸本想立夜初凉为后,但初登帝位,需要大臣的帮助,不得已之下立了一位高官嫡女为后。
在即将回到京城时,夜初凉生了重病,被送入行宫养病。不久,皇后有孕,夜初凉却中毒即将身亡。在危机时刻,从南疆跟来的侍女锦柔给夜初凉喂了一粒药,带着她回到南疆。
再次醒来时,夜初凉便成为了南疆神使。如同重生一般,之前的记忆不负存在,也没了七情六欲。
神使现,天下定,神使辅佐之人是未来天下之主。
在选辅佐之人时,夜初凉最终还是选择了尹祈,并辅佐他成为一代明帝,最后两人相忘于江湖,各自生活。